Peptydaza to enzym katalizujący proces hydrolizy wiązań peptydowych. W zależności od miejsca działania wyróżnia się endopeptydazę, która rozrywa wiązania peptydowe w środku łańcucha peptydowego oraz egzopeptydazę, odpowiedzialną za odcinanie pojedynczych aminokwasów od końców łańcucha peptydowego. W uproszczeniu można stwierdzić, że enzym ten pomaga trawić białko.
W suplementacji najczęściej wykorzystuje się peptydazę otrzymaną w procesie fermentacji grzybów z rodzaju Aspergillus oryze. Poleca się ją zwłaszcza osobom spożywającym duże ilości białka (sportowcy, osoby na dietach wysokobiałkowych).
Peptydaza zwykle jest dostępna w kompleksowych mieszankach enzymów trawiennych; można ją znaleźć również w składzie niektórych odżywek białkowych